祁连山国家公园地处青藏、蒙新、黄土三大高原交汇地带的祁连山北麓,总面积5.02万平方公里中,甘肃片区3.44万平方公里,青海片区1.58万平方公里,祁连山国家公园保护对象涵盖森林、草原、冰川、荒漠等生态系统,自然景观多样,平均海拔4000-5000米。是中国重要的生态功能区、西北地区重要生态安全屏障和水源涵养地。